Стандарт данных Darwin Core

Стандарт данных Darwin Core регламентирует указание как полных этикеточных данных о находке (один вид / особь, обнаруженная в одной точке, в одну дату, в одно время, одним методом), так и информацию о самой записи. Всего Darwin Core допускает существование порядка 160 полей, не считая расширений этого стандарта (например, Measurement or Facts, GBIF Relevé, Literature References и др.) и сервисных полей, автоматически создаваемых GBIF. Здесь мы приводим перевод названий и описаний лишь основных из них, а полный перечень полей и их описаний доступен на официальном сайте.

Несмотря на то, что GBIF и IPT сервера не предъявляют требований к порядку полей, для удобства заполнения и проверки принято группировать их в 6 блоков: RECORD, OCCURRENCE, EVENT, LOCATION, IDENTIFICATION и TAXON. Некоторые поля допускают заполнение двумя и более значениями с использованием разделителя « | » (например, «Vyatka & Kama interstream area | the Cis-Ural region | western piedmont of the Ural Mountains | the east of the Russian Plain» в поле locationRemarks или «Mikhailov Yu.E. | Ermakov A.I.» в поле recordedBy).

RECORD

Термин	Описание	Комментарии, примеры
datasetName	Название датасета	Spiders of the Udmurt Republic Small mammals of background areas in the vicinity of the Karabash copper smelter (Southern Ural, Russia)
type	Происхождение или категория записи	Одно из возможных значений, регламентированных здесь: Image – фотография или другое изображение Sound – запись звука PhysicalObject ­– физически хранящийся объект, подтверждающий запись Text – текст Event – событие, привязанное к определенному времени, но не подтверждаемое ни одним из вышеперечисленных вариантов.
basisOfRecord	Уточнение происхождения записи	Детализация значения, указанного в столбце type. Одно из возможных значений: PreservedSpecimen – хранящиеся в коллекции зафиксированные образцы. FossilSpecimen – хранящиеся в коллекции ископаемые образцы. LivingSpecimen – живые организмы. HumanObservation – наблюдение организма человеком. MachineObservation – наблюдение организма автоматизированными техническими средствами. и др.
modified	Последняя дата изменения записи	Максимально точное значение, допускается указание времени: 2009/2013 2012 2012-06 2012-06-23/30 2012-06-23 2012-06-23T14:07 и др.
language	Язык ресурса / датасета	Сокращение до двух букв: en ru и др.
license	Лицензия, регламентирующая использование записи	Чаще всего используют лицензию CC-BY, не налагающую никаких ограничений на использование, за исключением необходимости цитировать источник. Реже используют более либеральную (CC0) или более строгую (CC-BY-NC), или другие.
bibliographicCitation	Библиографическая ссылка	Полное библиографическое описание источника информации, если таковой имеется.
references	Источник	Ссылка на медиафайлы, страницы в сети, интерактивные ресурсы.
rightsHolder	Человек или организация, владеющая и/или управляющая данным ресурсом	Имя человека или полное название организации.
institutionID	Идентификатор организации	Идентификатор или URL ссылка на организацию, указанную в столбце rightsHolder.
institutionCode	Код (аббревиатура) организации	Аббревиатура или код организации, указанной в столбце rightsHolder.
dynamicProperties	Дополнительные характеристики	Структурированный список дополнительных фактов, измерений, характеристик, имеющих отношение к данной записи. Рекомендуется использовать JSON формат {"key":value} или {"key1":value1, "key2":value2}. {"relativeHumidity":28, "airTemperatureInCelsius":22, "aspectHeading":277, "slopeInDegrees":6}
informationWithheld	Дополнительная информация	Информация, которая представлена для данной записи, но не может быть вписана ни в один из регламентированных столбцов.

OCCURRENCE

Термин	Описание	Комментарии, примеры
occurrenceID	Идентификатор находки	Должен быть уникальным в пределах всего GBIF, поэтому рекомендуется создавать его как комбинацию из названия/идентификатора датасета (datasetName) и идентификатора в пределах датасета (catalogNumber). 866d2-c177-4648-a200-ad4751b9 urn:catalog:UWBM:Bird:89776
catalogNumber	Идентификатор находки в пределах датасета/коллекции	Уникальность идентификатора требуется только в пределах датасета.
recordNumber	Идентификатор находки в авторской системе учета	Идентификатор, который присваивается авторами в собственной системе учета: музейный код, код особи из полевого дневника или лабораторного журнала.
recordedBy	Коллектор	Перечень людей, групп и организаций, ответственных за появление данной записи.
organismQuantity	Обилие организма	Используется в комбинации со столбцом organismQuantityType. 27 (organismQuantity) individuals (organismQuantityType) 12.5 (organismQuantity) % biomass (organismQuantityType) r (organismQuantity) Braun-Blanquet Scale (organismQuantityType) 23 (organismQuantity) individuals per 100 traps*days (organismQuantityType)
organismQuantityType	Единицы измерения обилия организма	Используется в комбинации со столбцом organismQuantity. 27 (organismQuantity) individuals (organismQuantityType) 12.5 (organismQuantity) % biomass (organismQuantityType) r (organismQuantity) Braun-Blanquet Scale (organismQuantityType) 23 (organismQuantity) individuals per 100 traps*days (organismQuantityType)
individualCount	Количество особей	Количество особей, фигурирующих в данной записи.
sex	Пол особи (особей)	female male hermaphrodite 4 females 5 males | 1 female
lifeStage	Жизненная стадия или возрастной класс организмов	larva juvenile subadult adult seedling flowering fruiting
caste	Характеристика особи для социальных организмов	queen soldier minor worker и др.
occurrenceStatus	Факт присутствия или отсутствия организма	Вид обнаружен: present. Целенаправленные поиски вида не увенчались успехом или достоверно зафиксировано отсутствие вида: absent.
disposition	Коллекционный статус образца	in collection missing destroyed и др.
associatedReferences	Связанные источники	Список библиографических ссылок, URL адресов, doi и других идентификаторов литературных источников, связанных с данной записью.
associatedTaxa	Связанные таксоны	Список таксонов, связанных с данной записью. Тип местообитания записывается в поле habitat.
associatedOccurrences	Связанные находки	Список идентификаторов других записей датасета, связанных с данной записью.
associatedMedia	Связанные медиаресурсы	Список URL адресов, doi и других идентификаторов медиаресурсов, связанных с данной записью.
occurrenceRemarks	Примечания к записи	Вся дополнительная информация, имеющая отношение к данной записи (occurrence), которая не может быть вписана ни в один из регламентированных столбцов этого блока

EVENT

Термин	Описание	Комментарии, примеры
eventID	Идентификатор события, на основании которого сделана запись	Уникальный идентификатор для каждого события, — наблюдения, экспедиции, сбора материала, установки ловушек и фотоловушек, и др. Уникальным событием считается уникальное сочетание расположения, даты и метода сбора. l.347 T-2S_96 09-N
parentEventID	Идентификатор события, более общего по отношению к eventID	l.347_d.2011-7-14 T-2S_96-07-02 09-N-2009-07-07
eventDate	Дата события	Максимально подробная дата в формате год-месяц-день(-время) с возможностью указания интервала дат. 1900/1909 1971 2007-11-13/15 2009-07-18 1963-03-08T14:07
verbatimEventDate	Дата события дословно	Дата события в оригинальном формате, до приведения к стандарту Darwin Core.
startDayOfYear	Порядковый номер дня начала события	От 1 до 365 или до 366 в високосный год.
endDayOfYear	Порядковый номер дня окончания события	От 1 до 365 или до 366 в високосный год.
year	Год
month	Месяц
day	День
fieldNumber	Полевой номер	Идентификатор, присвоенный в момент сбора и указанный на этикетке, в полевом дневнике или лабораторном журнале.
habitat	Тип или описание местообитания, где происходило событие	Географическая составляющая фиксируется в блоке LOCATION. Так же можно задействовать поля eventRemarks, occurrenceRemarks, dynamicProperties и informationWithheld.
samplingProtocol	Протокол сбора	Название протокола, примененного при сборе, или ссылка на его описание.
samplingEffort	Выборочное усилие	40 trap-days 10 observer-hours
sampleSizeValue	Размер выборки	Числовое выражение размера выборки. Применяется совместно с полем sampleSizeUnit, в котором указываются единицы измерения. 1 (sampleSizeValue) dm^3 (sampleSizeUnit) 5 (sampleSizeValue) km of route (sampleSizeUnit)
sampleSizeUnit	Единицы измерения размера выборки	Единицы измерения, в которых выражен объем выборки в поле sampleSizeValue.Применяется совместно с полем sampleSizeValue, в котором указываются единицы измерения. 1 (sampleSizeValue) dm^3 (sampleSizeUnit) 5 (sampleSizeValue) km of route (sampleSizeUnit)
eventRemarks	Примечания к событию	Примечания и заметки, имеющие отношение к блоку EVENT, но не вписывающиеся ни в один из его блоков.

LOCATION

Термин	Описание	Комментарии, примеры
locationID	Идентификатор локалитета	Уникальный как минимум в пределах датасета идентификатор. Field_A L51.Ust'-Belsk
higherGeography	Общая география	Список более крупных географических наименований, к которым относится место, описываемое в блоке LOCATION. Urals | South Urals
continent	Континент	Asia Europe
waterBody	Водный объект	Наименование водного объекта, если локалитет расположен на воде.
country	Страна	Полное название страны.
countryCode	Код страны	Двухсимвольный код страны. RU KZ
stateProvince	Регион	Название административной единицы, на которые разделена страна, указанная в country. Для России – название области/края/республики. Для других стран таже возможны штат, провинция, кантон, департамент, регион.
county	Район	Название административной единицы, на которые разделен регион, указанный в stateProvince. Для России – название района. Для других стран таже возможны земля, графство, округ и др.
locality	Название / описание локалитета	The upper reaches of Ussuri River near the mouth of Zabyty Stream Vostok Bay 15 km north-west Soldatka
verbatimLocality	Локалитет дословно	Название локалитета в оригинальном варианте, до приведения к стандарту Darwin Core.
decimalLatitude	Широта	Широта в формате градусы и десятичные доли градуса.
decimalLongitude	Долгота	Долгота в формате градусы и десятичные доли градуса.
geodeticDatum	Датум	Эллипсоид, датум или пространственная система координат, в которой даны координаты в полях decimalLatitude и decimalLongitude. EPSG:4326 WGS84 и др.
coordinateUncertaintyInMeters	Неопределенность координат в метрах	Расстояние в метрах, описывающее окружность относительно указанных в decimalLatitude и decimalLongitude координат, пределах которой находится реальный локалитет. 30 м для большинства современных GPS устройств или другое, в зависимости от метода геопривязки, но никогда не 0. Это не валидное для этого поля значение, если неизвестно, то следует оставить пустым.
coordinatePrecision	Точность координат	Степень точности указанных в decimalLatitude и decimalLongitude координат. 0.00001 (для большинства современных GPS устройств) 0.000278 (до секунд) 0.01667 (до минут) 1.0 (до градусов)
georeferencedBy	Автор геопривязки
georeferencedDate	Дата геопривязки
elevation	Высота над уровнем моря
elevationAccuracy	Точность высоты над уровнем моря
minimumElevationInMeters	Нижняя граница высоты н.у.м.
maximumElevationInMeters	Верхняя граница высоты н.у.м.
locationRemarks	Примечания к локалитету	Примечания и заметки, имеющие отношение к блоку LOCATION, но не вписывающиеся ни в один из его столбцов.

IDENTIFICATION

Термин	Описание	Комментарии, примеры
identifiedBy	Автор таксономического определения
dateIdentified	Дата определения	Формат даты как в поле eventDate.
identificationRemarks	Примечания к определению	Примечания и заметки, имеющие отношение к блоку IDENTIFICATION, но не вписывающиеся ни в один из его столбцов. Примечания относительно всего таксона, а не конкретного экземпляра, сформулированные при определении, необходимо размещать в поле taxonRemarks.

TAXON

Термин	Описание	Комментарии, примеры
scientificName	Научное название	Полное название таксона, до которого определены организмы (ранг указан в поле taxonRank) на момент идентификации организма, включая автора и год описания, если известно.
acceptedNameUsage	Принятое научное название	Текущее валидное научное название организма.
vernacularName	Народное название	Национальное или бытовое название организма.
kingdom	Царство
phylum	Тип
class	Класс
order	Отряд/Порядок
family	Семейство
genus	Родовое название
specificEpithet	Видовой эпитет
scientificNameAuthorship	Автор (и год) описания таксона	Если автор и год приводятся в скобках, то здесь их тоже следует указать.
taxonRank	Ранг таксона	FAMILY GENUS SPECIES SUBSPECIES и др.
typeStatus	Типовой статус	Типовой статус данного экземпляра/серии. Holotype Paratype и др.
taxonRemarks	Примечания к таксону	Примечания и заметки, имеющие отношение к таксону, приводимому в блоке TAXON, но не вписывающиеся ни в один из его столбцов. Примечания относительно таксономии конкретного экземпляра, сформулированные при определении, необходимо размещать в поле identificationRemarks.